La Red INVIPESCA organiza un curso online y gratuito sobre el manejo y aplicaciones de STERapp en el marco del V SIBECORP

La red INVIPESCA organiza un curso online gratuito sobre el manejo y aplicaciones de STERapp que formará parte de la programación del V Simposio Iberoamericano de Ecología Reproductiva, Reclutamiento y Pesquerías SIBECORP, que se celebra en octubre en formato virtual. El curso será impartido por Sonia Rábade (IIM-CSIC, España) y Rosario Domínguez-Petit (IEO, España).

El software STERapp ha sido desarrollado por el CiTIUS de la Universidad de Santiago de Compostela en colaboración con el Laboratorio de Informática Aplicada de la Universidad de Vigo y dos laboratorios del CSIC en Vigo (IEO e IIM). Se trata de una aplicación de escritorio que permite realizar, semiautomáticamente, el análisis estereológico de estructuras a partir de imágenes. En concreto, STERapp incorpora un módulo de análisis de imágenes histológicas de ovarios de peces para la estimación de parámetros reproductivos como la fecundidad, parámetro fundamental en el estudio de dinámica de poblaciones y evaluación de stocks explotados por la pesca.

STERapp utiliza herramientas de inteligencia artificial para el análisis automático de imágenes y herramientas de control manual para la supervisión de resultados, mediante una interfaz gráfica intuitiva y amigable. La aplicación detecta y clasifica los diferentes tipos de objetos presentes en la imagen, en este caso los diferentes estados de ovocitos en el ovario, incluyendo un módulo de entrenamiento del clasificador basado en técnicas de aprendizaje automático. Los objetos reconocidos y clasificados se guardan en archivos XML que puedan ser consultados en cualquier momento posterior, mientras que los resultados de la cuantificación de objetos se guardan en archivos CSV, facilitando su posterior análisis estadístico.

STERapp es flexible y se puede entrenar para incorporar nuevas especies para el análisis y nuevas categorías de objetos. También es modular, ya que permite la extensión a nuevas aplicaciones de estereología simplemente definiendo nuevos algoritmos de visión por computadora y aprendizaje automático para realizar el reconocimiento automático y la clasificación de estructuras de interés.

STERapp es un software libre y gratuito y está disponible, en versión Windows y Linux, en el siguiente enlace https://citius.usc.es/transferencia/software/sterapp, donde también se puede encontrar el manual de la aplicación, el artículo científico publicado en la revista Electronics y un repositorio con las imágenes procesadas que se utilizaron para dicho artículo.

Para más información sobre el curso a desarrollar en el V SIBECORP, contactar con los organizadores del simposio vía email (sibecorp5@gmail.com o sibecorp5@unimagdalena.edu.co).